脊索动物包括：尾索、头索和脊惟动物等三大类。尾索动物中最常见的是海稍，它们的身体通常由一层含纤维素的稍或皮膜包覆，身体贝有人、出水孔，靠过滤海水中的有机颗粒或小生物维生。海稍有群体型和单体型两大类，它们通常附着在礁石缝隙或隐蔽处，体型小，并不是很显眼的生物，但是模样虽小，却造形精致、颜色艳丽，而且颇吉田变化，它们还是脊惟动物的近亲呢:有一些海稍进行浮游生活，它们以许多个体串联在一起，利用协调一致的吸水与喷水的动作，缓慢行进。
头索动物又称文昌鱼，它们是生活在沙质海底的小生物。在南湾海域的沙底中，曾发现一种被称为﹁恒春文昌鱼﹂的特殊小头索动物，虽然它们并不起眼，也无经济价值，但却是最原始的脊索动物之一，因此在学术研究上，还是占有一席之地的。脊惟动物是最进化的一群生物，除了数量众多的珊瑚礁鱼类之外，属于爬虫类的海蛇，也经常在垦丁海域出没。海蛇具侧扁的尾部，利于游泳，它们腹部的鳞片退化，已经失去爬行的功能，但是仍然用肺呼吸，因此在水中停留一阵于后，就必须到水面上换气：海蛇的毒牙通常具有强烈的毒性，但它们却是非常温驯的动物，如果不是遭受恶意的攻击，它们并不会主动攻击人。偶尔在垦丁海域出现的海龟或袱帽，也是爬虫类动物，它们的四肢成缮状，游泳能力强，嗜食小鱼，因此所到之处，鱼类往往纷纷躲避。
珊瑚礁生态孙中庞杂的生物，借着食物网的关系而联结在一起，食物网不仅代表着﹁吃﹂与﹁被吃﹂ 的关系，同时也表在这个生态中，能量传递的途径。这个食物网的基层是生产者，包括：珊瑚体内的共生藻、海水中浮游生活的微捆藻类和附着在底质上的大型海藻及海草。这些生产者可以进行光合作用，吸收太阳能，把二氧化碳和水分于，化合成醣类：醣类则可破许多初级消费者，也就是草食性的动物，包括浮游动物、贝类、虾、蟹、小鱼等利用。这些草食性动物，再被肉食性动物捕食。生物死亡后的尸体，又被再度分解，重新进入食物网的循环。食物网代表着一个生态系的生物间，彼此相依共存的密切关系，任何一个环节的破坏，都可能牵一发而动全身，使整个生态系遭受很大的影响。因此，从这个观点看来，珊瑚礁上林林总总的生物，不论是人是小，无分简单或复杂，都是生物世界中的二皿，也都有庄严的生命价值。
资料来源：
资料日期：2003-05-02
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